もちろん、WordPressにもメリットばかりではなく、欠点や問題点などもあります。
ですが、それらのデメリットのなかには、対処可能はものもあります。
◎ページの表示が遅い

プラグインである程度解決できます。
◎プラグインの自由度が高い分、セキュリティーがあまいという批判がある。
◎セキュリティーがあまいという批判がある。

セキュリティーを高めるプラグインがあります。
セキュリティーを高めるための対処法もあります。
◎デフォルトの状態ではそこまで高いSEO効果があるわけではない。

WordPressには、SEOに有効なプラグインがたくさんあります。
WordPressを使っているSEOのプロたちも、そうしたプラグインを利用しています。
◎一回のインストールで複数のブログを運営することができない。
複数のブログ(ウェブサイト)を作成するためには、WordPressを複数インストールしなければならない。

WordPress MUを使うことで実現できます。
次のバージョンのWordPress3.0で改善されることになっています。
これらの問題は、世界中の優秀なプログラマーたちや、
ユーザーたちによって日々改善されています。
ですので、これから良くなることはあっても、悪くなることは考えられません。
◎オートパラグラフ(自動整形表示)機能

改善されつつある
プラグイン
◎商用サイトでは、オプション機能のひとつであるAkismetの利用が有料になる。

Akismetを使わなくても、ほかのプラグインで対処することができる。
◎無料で利用できて、自由にカスタマイズできる反面、メーカーの保証がない。

基本的に、保証がなくても問題ありません。
もしも、メーカーの保証が欲しい場合は、WordPress(ワードプレス)の開発元である、Automattic社( http://automattic.com/ )による有償サポートサービスが提供されています。